Het onderwijs op de Willem van Veenschool is georganiseerd volgens het leerstof-jaarklassensysteem. Dat wil zeggen dat kinderen op grond van hun leeftijd en ontwikkelingsniveau in een groep geplaatst worden. Wanneer een kind voldoende ontwikkeling laat zien, wordt hij of zij aan het einde van het schooljaar bevorderd naar de volgende groep. De school streeft op deze manier naar een ononderbroken ontwikkeling van groep 1 tot en met groep 8.